Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cbx1P83917 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cbx1P83917 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cbx1P83917 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cbx1P83917 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cbx1P83917 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cbx1P83917 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cbx1P83917 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cbx1P83917 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cbx1P83917 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cbx1P83917 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cbx1P83917 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cbx1P83917 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cbx1P83917 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cbx1P83917 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cbx1P83917 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cbx1P83917 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cbx1P83917 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms