Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TgfbiP82198 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TgfbiP82198 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TgfbiP82198 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TgfbiP82198 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TgfbiP82198 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TgfbiP82198 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TgfbiP82198 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TgfbiP82198 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TgfbiP82198 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TgfbiP82198 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TgfbiP82198 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TgfbiP82198 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TgfbiP82198 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TgfbiP82198 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TgfbiP82198 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TgfbiP82198 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TgfbiP82198 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TgfbiP82198 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TgfbiP82198 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TgfbiP82198 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TgfbiP82198 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TgfbiP82198 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TgfbiP82198 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TgfbiP82198 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TgfbiP82198 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TgfbiP82198 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TgfbiP82198 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TgfbiP82198 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TgfbiP82198 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TgfbiP82198 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TgfbiP82198 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TgfbiP82198 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TgfbiP82198 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TgfbiP82198 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TgfbiP82198 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TgfbiP82198 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TgfbiP82198 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TgfbiP82198 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TgfbiP82198 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TgfbiP82198 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TgfbiP82198 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TgfbiP82198 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TgfbiP82198 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TgfbiP82198 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TgfbiP82198 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TgfbiP82198 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TgfbiP82198 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TgfbiP82198 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TgfbiP82198 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TgfbiP82198 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TgfbiP82198 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms