Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q6P79568 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q6P79568 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q6P79568 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-Q6P79568 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q6P79568 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q6P79568 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q6P79568 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q6P79568 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q6P79568 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q6P79568 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q6P79568 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q6P79568 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q6P79568 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q6P79568 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Q6P79568 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Q6P79568 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Q6P79568 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Q6P79568 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-Q6P79568 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q6P79568 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Q6P79568 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-Q6P79568 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q6P79568 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q6P79568 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q6P79568 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q6P79568 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q6P79568 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-Q6P79568 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H2-Q6P79568 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2-Q6P79568 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Q6P79568 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-Q6P79568 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-Q6P79568 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-Q6P79568 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q6P79568 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q6P79568 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q6P79568 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q6P79568 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q6P79568 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q6P79568 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q6P79568 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q6P79568 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q6P79568 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q6P79568 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q6P79568 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q6P79568 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q6P79568 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q6P79568 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q6P79568 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q6P79568 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q6P79568 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q6P79568 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q6P79568 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q6P79568 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q6P79568 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Q6P79568 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q6P79568 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q6P79568 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q6P79568 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q6P79568 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q6P79568 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q6P79568 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q6P79568 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q6P79568 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms