Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh10P70408 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh10P70408 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh10P70408 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh10P70408 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh10P70408 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh10P70408 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh10P70408 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh10P70408 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh10P70408 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdh10P70408 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdh10P70408 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdh10P70408 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdh10P70408 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdh10P70408 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh10P70408 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh10P70408 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh10P70408 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh10P70408 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh10P70408 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdh10P70408 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh10P70408 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh10P70408 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdh10P70408 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdh10P70408 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdh10P70408 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cdh10P70408 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdh10P70408 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdh10P70408 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh10P70408 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh10P70408 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh10P70408 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh10P70408 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh10P70408 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh10P70408 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh10P70408 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh10P70408 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh10P70408 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh10P70408 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh10P70408 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh10P70408 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh10P70408 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh10P70408 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh10P70408 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh10P70408 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms