Protein–RNA interactions for Protein: P70387

Hfe, Hereditary hemochromatosis protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HfeP70387 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HfeP70387 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HfeP70387 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HfeP70387 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HfeP70387 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HfeP70387 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HfeP70387 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HfeP70387 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HfeP70387 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HfeP70387 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HfeP70387 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HfeP70387 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HfeP70387 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HfeP70387 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HfeP70387 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HfeP70387 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HfeP70387 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HfeP70387 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HfeP70387 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HfeP70387 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HfeP70387 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HfeP70387 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HfeP70387 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HfeP70387 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HfeP70387 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HfeP70387 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HfeP70387 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HfeP70387 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HfeP70387 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HfeP70387 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HfeP70387 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HfeP70387 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HfeP70387 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HfeP70387 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HfeP70387 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HfeP70387 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HfeP70387 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HfeP70387 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HfeP70387 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HfeP70387 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HfeP70387 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HfeP70387 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HfeP70387 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HfeP70387 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HfeP70387 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HfeP70387 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HfeP70387 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HfeP70387 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HfeP70387 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HfeP70387 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HfeP70387 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HfeP70387 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HfeP70387 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HfeP70387 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HfeP70387 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HfeP70387 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HfeP70387 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HfeP70387 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HfeP70387 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HfeP70387 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HfeP70387 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HfeP70387 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HfeP70387 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HfeP70387 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HfeP70387 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HfeP70387 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HfeP70387 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HfeP70387 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HfeP70387 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HfeP70387 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HfeP70387 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HfeP70387 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HfeP70387 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HfeP70387 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HfeP70387 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HfeP70387 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HfeP70387 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HfeP70387 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HfeP70387 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HfeP70387 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HfeP70387 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HfeP70387 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HfeP70387 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HfeP70387 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HfeP70387 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HfeP70387 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HfeP70387 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HfeP70387 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HfeP70387 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HfeP70387 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HfeP70387 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HfeP70387 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HfeP70387 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HfeP70387 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HfeP70387 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HfeP70387 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HfeP70387 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HfeP70387 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HfeP70387 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HfeP70387 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms