Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbx6P70327 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbx6P70327 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tbx6P70327 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tbx6P70327 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbx6P70327 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbx6P70327 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tbx6P70327 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbx6P70327 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbx6P70327 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbx6P70327 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tbx6P70327 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbx6P70327 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbx6P70327 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbx6P70327 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbx6P70327 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tbx6P70327 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbx6P70327 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tbx6P70327 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbx6P70327 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tbx6P70327 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbx6P70327 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tbx6P70327 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbx6P70327 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbx6P70327 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tbx6P70327 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbx6P70327 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tbx6P70327 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tbx6P70327 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tbx6P70327 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbx6P70327 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tbx6P70327 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbx6P70327 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbx6P70327 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tbx6P70327 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbx6P70327 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tbx6P70327 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbx6P70327 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbx6P70327 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tbx6P70327 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tbx6P70327 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms