Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NfixP70257 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NfixP70257 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NfixP70257 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NfixP70257 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NfixP70257 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NfixP70257 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NfixP70257 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NfixP70257 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NfixP70257 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NfixP70257 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NfixP70257 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NfixP70257 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NfixP70257 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NfixP70257 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NfixP70257 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NfixP70257 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NfixP70257 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NfixP70257 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NfixP70257 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NfixP70257 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
NfixP70257 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NfixP70257 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NfixP70257 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NfixP70257 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NfixP70257 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NfixP70257 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NfixP70257 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NfixP70257 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NfixP70257 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NfixP70257 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NfixP70257 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NfixP70257 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NfixP70257 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NfixP70257 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NfixP70257 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NfixP70257 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NfixP70257 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NfixP70257 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NfixP70257 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NfixP70257 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NfixP70257 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NfixP70257 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NfixP70257 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NfixP70257 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NfixP70257 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NfixP70257 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NfixP70257 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NfixP70257 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NfixP70257 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NfixP70257 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NfixP70257 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NfixP70257 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NfixP70257 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NfixP70257 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NfixP70257 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NfixP70257 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NfixP70257 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NfixP70257 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NfixP70257 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NfixP70257 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NfixP70257 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NfixP70257 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NfixP70257 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NfixP70257 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NfixP70257 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NfixP70257 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NfixP70257 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NfixP70257 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NfixP70257 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NfixP70257 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NfixP70257 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NfixP70257 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NfixP70257 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NfixP70257 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NfixP70257 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NfixP70257 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NfixP70257 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NfixP70257 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NfixP70257 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NfixP70257 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NfixP70257 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NfixP70257 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NfixP70257 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NfixP70257 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NfixP70257 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NfixP70257 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NfixP70257 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NfixP70257 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NfixP70257 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NfixP70257 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NfixP70257 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NfixP70257 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NfixP70257 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NfixP70257 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NfixP70257 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NfixP70257 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NfixP70257 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NfixP70257 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NfixP70257 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms