Protein–RNA interactions for Protein: P70166

Cpeb1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpeb1P70166 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpeb1P70166 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpeb1P70166 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpeb1P70166 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpeb1P70166 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpeb1P70166 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpeb1P70166 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpeb1P70166 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpeb1P70166 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpeb1P70166 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpeb1P70166 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpeb1P70166 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpeb1P70166 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpeb1P70166 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpeb1P70166 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpeb1P70166 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpeb1P70166 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpeb1P70166 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpeb1P70166 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpeb1P70166 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpeb1P70166 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpeb1P70166 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpeb1P70166 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpeb1P70166 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpeb1P70166 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpeb1P70166 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpeb1P70166 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpeb1P70166 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpeb1P70166 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpeb1P70166 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpeb1P70166 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpeb1P70166 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpeb1P70166 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cpeb1P70166 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpeb1P70166 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpeb1P70166 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpeb1P70166 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpeb1P70166 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpeb1P70166 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpeb1P70166 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpeb1P70166 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpeb1P70166 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpeb1P70166 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpeb1P70166 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpeb1P70166 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpeb1P70166 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpeb1P70166 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms