Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tubb4bP68372 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubb4bP68372 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubb4bP68372 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubb4bP68372 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubb4bP68372 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubb4bP68372 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubb4bP68372 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubb4bP68372 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubb4bP68372 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubb4bP68372 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubb4bP68372 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubb4bP68372 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubb4bP68372 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubb4bP68372 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tubb4bP68372 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubb4bP68372 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubb4bP68372 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubb4bP68372 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubb4bP68372 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubb4bP68372 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubb4bP68372 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubb4bP68372 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubb4bP68372 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tubb4bP68372 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tubb4bP68372 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb4bP68372 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb4bP68372 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb4bP68372 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb4bP68372 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb4bP68372 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb4bP68372 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb4bP68372 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb4bP68372 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb4bP68372 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb4bP68372 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb4bP68372 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb4bP68372 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb4bP68372 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb4bP68372 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb4bP68372 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb4bP68372 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb4bP68372 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb4bP68372 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb4bP68372 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb4bP68372 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.1 ms