Protein–RNA interactions for Protein: P63248

Pkia, cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkiaP63248 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PkiaP63248 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PkiaP63248 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PkiaP63248 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PkiaP63248 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PkiaP63248 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PkiaP63248 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PkiaP63248 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PkiaP63248 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PkiaP63248 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PkiaP63248 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms