Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf2bP62915 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf2bP62915 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2bP62915 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2bP62915 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf2bP62915 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf2bP62915 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf2bP62915 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2bP62915 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2bP62915 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2bP62915 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gtf2bP62915 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf2bP62915 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2bP62915 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2bP62915 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2bP62915 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2bP62915 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2bP62915 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2bP62915 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2bP62915 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2bP62915 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2bP62915 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2bP62915 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2bP62915 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gtf2bP62915 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2bP62915 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2bP62915 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gtf2bP62915 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtf2bP62915 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtf2bP62915 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2bP62915 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2bP62915 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtf2bP62915 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2bP62915 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2bP62915 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtf2bP62915 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtf2bP62915 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2bP62915 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtf2bP62915 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2bP62915 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2bP62915 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2bP62915 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2bP62915 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2bP62915 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf2bP62915 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf2bP62915 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf2bP62915 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf2bP62915 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2bP62915 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2bP62915 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2bP62915 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2bP62915 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2bP62915 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2bP62915 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2bP62915 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2bP62915 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2bP62915 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2bP62915 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2bP62915 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2bP62915 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2bP62915 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2bP62915 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2bP62915 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2bP62915 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2bP62915 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2bP62915 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2bP62915 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2bP62915 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2bP62915 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2bP62915 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf2bP62915 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2bP62915 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2bP62915 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf2bP62915 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gtf2bP62915 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2bP62915 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2bP62915 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtf2bP62915 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2bP62915 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2bP62915 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2bP62915 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf2bP62915 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2bP62915 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf2bP62915 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2bP62915 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2bP62915 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf2bP62915 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf2bP62915 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf2bP62915 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2bP62915 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2bP62915 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf2bP62915 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2bP62915 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2bP62915 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2bP62915 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2bP62915 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2bP62915 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf2bP62915 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf2bP62915 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2bP62915 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms