Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl23P62830 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpl23P62830 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl23P62830 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms