Protein–RNA interactions for Protein: P62500

Tsc22d1, TSC22 domain family protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d1P62500 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsc22d1P62500 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsc22d1P62500 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsc22d1P62500 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsc22d1P62500 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsc22d1P62500 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsc22d1P62500 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsc22d1P62500 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsc22d1P62500 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsc22d1P62500 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsc22d1P62500 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsc22d1P62500 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsc22d1P62500 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsc22d1P62500 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsc22d1P62500 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tsc22d1P62500 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsc22d1P62500 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsc22d1P62500 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsc22d1P62500 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tsc22d1P62500 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsc22d1P62500 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsc22d1P62500 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsc22d1P62500 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsc22d1P62500 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsc22d1P62500 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsc22d1P62500 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsc22d1P62500 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsc22d1P62500 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsc22d1P62500 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsc22d1P62500 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsc22d1P62500 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsc22d1P62500 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsc22d1P62500 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsc22d1P62500 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsc22d1P62500 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsc22d1P62500 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tsc22d1P62500 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsc22d1P62500 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tsc22d1P62500 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsc22d1P62500 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tsc22d1P62500 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsc22d1P62500 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsc22d1P62500 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsc22d1P62500 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsc22d1P62500 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsc22d1P62500 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tsc22d1P62500 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tsc22d1P62500 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tsc22d1P62500 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tsc22d1P62500 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsc22d1P62500 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsc22d1P62500 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsc22d1P62500 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsc22d1P62500 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tsc22d1P62500 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tsc22d1P62500 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsc22d1P62500 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tsc22d1P62500 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsc22d1P62500 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsc22d1P62500 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsc22d1P62500 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tsc22d1P62500 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsc22d1P62500 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsc22d1P62500 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsc22d1P62500 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tsc22d1P62500 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsc22d1P62500 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsc22d1P62500 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsc22d1P62500 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsc22d1P62500 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsc22d1P62500 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tsc22d1P62500 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc22d1P62500 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc22d1P62500 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc22d1P62500 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc22d1P62500 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc22d1P62500 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsc22d1P62500 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsc22d1P62500 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsc22d1P62500 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsc22d1P62500 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms