Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmc1P62192 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmc1P62192 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmc1P62192 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmc1P62192 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmc1P62192 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmc1P62192 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmc1P62192 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmc1P62192 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmc1P62192 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmc1P62192 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Psmc1P62192 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psmc1P62192 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psmc1P62192 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmc1P62192 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Psmc1P62192 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmc1P62192 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmc1P62192 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Psmc1P62192 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmc1P62192 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmc1P62192 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Psmc1P62192 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Psmc1P62192 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmc1P62192 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmc1P62192 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmc1P62192 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psmc1P62192 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psmc1P62192 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmc1P62192 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmc1P62192 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmc1P62192 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmc1P62192 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmc1P62192 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmc1P62192 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmc1P62192 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmc1P62192 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmc1P62192 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Psmc1P62192 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Psmc1P62192 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Psmc1P62192 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmc1P62192 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psmc1P62192 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psmc1P62192 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Psmc1P62192 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc1P62192 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc1P62192 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc1P62192 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc1P62192 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmc1P62192 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmc1P62192 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmc1P62192 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmc1P62192 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmc1P62192 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmc1P62192 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmc1P62192 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmc1P62192 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmc1P62192 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmc1P62192 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmc1P62192 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmc1P62192 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmc1P62192 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmc1P62192 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmc1P62192 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmc1P62192 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmc1P62192 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmc1P62192 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmc1P62192 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmc1P62192 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmc1P62192 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Psmc1P62192 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmc1P62192 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmc1P62192 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmc1P62192 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmc1P62192 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmc1P62192 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmc1P62192 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmc1P62192 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc1P62192 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc1P62192 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc1P62192 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms