Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Smg6P61406 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Smg6P61406 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Smg6P61406 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Smg6P61406 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Smg6P61406 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Smg6P61406 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Smg6P61406 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Smg6P61406 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Smg6P61406 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Smg6P61406 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Smg6P61406 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smg6P61406 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smg6P61406 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smg6P61406 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smg6P61406 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smg6P61406 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smg6P61406 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smg6P61406 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Smg6P61406 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Smg6P61406 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Smg6P61406 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Smg6P61406 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Smg6P61406 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Smg6P61406 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Smg6P61406 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Smg6P61406 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Smg6P61406 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Smg6P61406 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Smg6P61406 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Smg6P61406 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
Smg6P61406 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Smg6P61406 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Smg6P61406 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Smg6P61406 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Smg6P61406 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Smg6P61406 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Smg6P61406 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Smg6P61406 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smg6P61406 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smg6P61406 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smg6P61406 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smg6P61406 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smg6P61406 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Smg6P61406 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smg6P61406 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smg6P61406 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Smg6P61406 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Smg6P61406 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Smg6P61406 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Smg6P61406 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Smg6P61406 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Smg6P61406 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Smg6P61406 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Smg6P61406 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Smg6P61406 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Smg6P61406 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Smg6P61406 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smg6P61406 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Smg6P61406 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Smg6P61406 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Smg6P61406 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Smg6P61406 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Smg6P61406 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms