Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppfia3P60469 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppfia3P60469 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppfia3P60469 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppfia3P60469 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppfia3P60469 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppfia3P60469 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppfia3P60469 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppfia3P60469 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppfia3P60469 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppfia3P60469 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppfia3P60469 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppfia3P60469 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppfia3P60469 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppfia3P60469 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppfia3P60469 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppfia3P60469 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppfia3P60469 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppfia3P60469 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppfia3P60469 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppfia3P60469 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppfia3P60469 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppfia3P60469 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppfia3P60469 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppfia3P60469 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppfia3P60469 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppfia3P60469 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppfia3P60469 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppfia3P60469 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppfia3P60469 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppfia3P60469 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppfia3P60469 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppfia3P60469 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppfia3P60469 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppfia3P60469 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppfia3P60469 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppfia3P60469 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppfia3P60469 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppfia3P60469 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppfia3P60469 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppfia3P60469 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppfia3P60469 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppfia3P60469 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppfia3P60469 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppfia3P60469 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppfia3P60469 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppfia3P60469 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppfia3P60469 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppfia3P60469 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ppfia3P60469 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ppfia3P60469 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppfia3P60469 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppfia3P60469 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppfia3P60469 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppfia3P60469 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppfia3P60469 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppfia3P60469 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppfia3P60469 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppfia3P60469 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppfia3P60469 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppfia3P60469 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppfia3P60469 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppfia3P60469 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppfia3P60469 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppfia3P60469 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ppfia3P60469 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ppfia3P60469 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms