Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CebpaP53566 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CebpaP53566 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
CebpaP53566 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CebpaP53566 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CebpaP53566 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CebpaP53566 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CebpaP53566 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CebpaP53566 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CebpaP53566 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CebpaP53566 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CebpaP53566 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CebpaP53566 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CebpaP53566 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CebpaP53566 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CebpaP53566 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CebpaP53566 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CebpaP53566 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CebpaP53566 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CebpaP53566 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CebpaP53566 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CebpaP53566 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CebpaP53566 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CebpaP53566 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CebpaP53566 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CebpaP53566 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CebpaP53566 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CebpaP53566 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CebpaP53566 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CebpaP53566 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CebpaP53566 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CebpaP53566 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CebpaP53566 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CebpaP53566 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CebpaP53566 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CebpaP53566 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CebpaP53566 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CebpaP53566 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CebpaP53566 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CebpaP53566 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CebpaP53566 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CebpaP53566 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CebpaP53566 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CebpaP53566 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CebpaP53566 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CebpaP53566 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CebpaP53566 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CebpaP53566 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CebpaP53566 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CebpaP53566 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CebpaP53566 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CebpaP53566 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CebpaP53566 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CebpaP53566 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CebpaP53566 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CebpaP53566 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CebpaP53566 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CebpaP53566 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CebpaP53566 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CebpaP53566 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CebpaP53566 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CebpaP53566 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CebpaP53566 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CebpaP53566 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CebpaP53566 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CebpaP53566 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CebpaP53566 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CebpaP53566 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CebpaP53566 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CebpaP53566 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CebpaP53566 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CebpaP53566 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CebpaP53566 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CebpaP53566 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CebpaP53566 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CebpaP53566 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CebpaP53566 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CebpaP53566 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CebpaP53566 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CebpaP53566 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CebpaP53566 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms