Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Map3k1P53349 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Map3k1P53349 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Map3k1P53349 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Map3k1P53349 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Map3k1P53349 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Map3k1P53349 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Map3k1P53349 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Map3k1P53349 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Map3k1P53349 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Map3k1P53349 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.79
Map3k1P53349 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Map3k1P53349 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Map3k1P53349 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
Map3k1P53349 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Map3k1P53349 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Map3k1P53349 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Map3k1P53349 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
Map3k1P53349 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Map3k1P53349 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Map3k1P53349 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Map3k1P53349 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Map3k1P53349 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Map3k1P53349 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Map3k1P53349 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Map3k1P53349 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Map3k1P53349 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Map3k1P53349 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Map3k1P53349 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
Map3k1P53349 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Map3k1P53349 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Map3k1P53349 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Map3k1P53349 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Map3k1P53349 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Map3k1P53349 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Map3k1P53349 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Map3k1P53349 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Map3k1P53349 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Map3k1P53349 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Map3k1P53349 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Map3k1P53349 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Map3k1P53349 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Map3k1P53349 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Map3k1P53349 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Map3k1P53349 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Map3k1P53349 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Map3k1P53349 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Map3k1P53349 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Map3k1P53349 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Map3k1P53349 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Map3k1P53349 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Map3k1P53349 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Map3k1P53349 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Map3k1P53349 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Map3k1P53349 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Map3k1P53349 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Map3k1P53349 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Map3k1P53349 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Map3k1P53349 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
Map3k1P53349 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Map3k1P53349 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Map3k1P53349 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Map3k1P53349 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Map3k1P53349 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Map3k1P53349 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Map3k1P53349 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Map3k1P53349 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Map3k1P53349 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Map3k1P53349 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Map3k1P53349 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Map3k1P53349 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Map3k1P53349 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Map3k1P53349 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Map3k1P53349 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Map3k1P53349 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Map3k1P53349 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Map3k1P53349 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Map3k1P53349 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Map3k1P53349 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Map3k1P53349 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Map3k1P53349 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Map3k1P53349 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Map3k1P53349 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Map3k1P53349 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Map3k1P53349 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Map3k1P53349 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Map3k1P53349 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Map3k1P53349 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Map3k1P53349 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Map3k1P53349 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Map3k1P53349 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Map3k1P53349 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Map3k1P53349 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Map3k1P53349 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Map3k1P53349 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Map3k1P53349 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Map3k1P53349 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Map3k1P53349 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Map3k1P53349 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Map3k1P53349 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms