Protein–RNA interactions for Protein: P52623

Uck1, Uridine-cytidine kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uck1P52623 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uck1P52623 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uck1P52623 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uck1P52623 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uck1P52623 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uck1P52623 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uck1P52623 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uck1P52623 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uck1P52623 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uck1P52623 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uck1P52623 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Uck1P52623 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uck1P52623 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Uck1P52623 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Uck1P52623 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uck1P52623 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uck1P52623 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uck1P52623 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uck1P52623 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uck1P52623 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uck1P52623 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Uck1P52623 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uck1P52623 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uck1P52623 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uck1P52623 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uck1P52623 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uck1P52623 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uck1P52623 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uck1P52623 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uck1P52623 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uck1P52623 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uck1P52623 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uck1P52623 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uck1P52623 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uck1P52623 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uck1P52623 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uck1P52623 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uck1P52623 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uck1P52623 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uck1P52623 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uck1P52623 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Uck1P52623 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uck1P52623 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uck1P52623 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uck1P52623 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uck1P52623 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uck1P52623 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uck1P52623 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uck1P52623 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uck1P52623 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uck1P52623 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uck1P52623 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uck1P52623 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uck1P52623 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uck1P52623 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uck1P52623 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uck1P52623 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uck1P52623 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uck1P52623 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uck1P52623 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uck1P52623 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uck1P52623 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uck1P52623 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uck1P52623 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uck1P52623 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uck1P52623 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uck1P52623 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uck1P52623 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uck1P52623 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Uck1P52623 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uck1P52623 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uck1P52623 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uck1P52623 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uck1P52623 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uck1P52623 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uck1P52623 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uck1P52623 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uck1P52623 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uck1P52623 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uck1P52623 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uck1P52623 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uck1P52623 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms