Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ube2e1P52482 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2e1P52482 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ube2e1P52482 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2e1P52482 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2e1P52482 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e1P52482 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e1P52482 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2e1P52482 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2e1P52482 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2e1P52482 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2e1P52482 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2e1P52482 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2e1P52482 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2e1P52482 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2e1P52482 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2e1P52482 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ube2e1P52482 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ube2e1P52482 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2e1P52482 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2e1P52482 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2e1P52482 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2e1P52482 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2e1P52482 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2e1P52482 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ube2e1P52482 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2e1P52482 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ube2e1P52482 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e1P52482 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e1P52482 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e1P52482 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ube2e1P52482 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217.9 ms