Protein–RNA interactions for Protein: P51942

Matn1, Cartilage matrix protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn1P51942 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Matn1P51942 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Matn1P51942 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Matn1P51942 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Matn1P51942 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Matn1P51942 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Matn1P51942 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Matn1P51942 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Matn1P51942 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Matn1P51942 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Matn1P51942 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Matn1P51942 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Matn1P51942 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Matn1P51942 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Matn1P51942 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Matn1P51942 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Matn1P51942 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Matn1P51942 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Matn1P51942 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Matn1P51942 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Matn1P51942 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Matn1P51942 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Matn1P51942 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Matn1P51942 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Matn1P51942 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Matn1P51942 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Matn1P51942 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Matn1P51942 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Matn1P51942 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Matn1P51942 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Matn1P51942 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Matn1P51942 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Matn1P51942 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Matn1P51942 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Matn1P51942 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Matn1P51942 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Matn1P51942 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Matn1P51942 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Matn1P51942 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Matn1P51942 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Matn1P51942 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Matn1P51942 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Matn1P51942 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Matn1P51942 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Matn1P51942 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Matn1P51942 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Matn1P51942 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Matn1P51942 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Matn1P51942 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Matn1P51942 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Matn1P51942 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Matn1P51942 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Matn1P51942 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Matn1P51942 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Matn1P51942 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Matn1P51942 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Matn1P51942 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Matn1P51942 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Matn1P51942 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Matn1P51942 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Matn1P51942 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Matn1P51942 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 407.6 ms