Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lhx3P50481 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lhx3P50481 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lhx3P50481 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lhx3P50481 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lhx3P50481 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lhx3P50481 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lhx3P50481 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lhx3P50481 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lhx3P50481 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lhx3P50481 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lhx3P50481 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lhx3P50481 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lhx3P50481 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lhx3P50481 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lhx3P50481 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lhx3P50481 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lhx3P50481 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lhx3P50481 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lhx3P50481 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lhx3P50481 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lhx3P50481 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lhx3P50481 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lhx3P50481 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lhx3P50481 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lhx3P50481 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lhx3P50481 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lhx3P50481 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lhx3P50481 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lhx3P50481 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lhx3P50481 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lhx3P50481 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lhx3P50481 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lhx3P50481 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lhx3P50481 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lhx3P50481 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lhx3P50481 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lhx3P50481 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lhx3P50481 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lhx3P50481 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Lhx3P50481 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lhx3P50481 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lhx3P50481 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lhx3P50481 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lhx3P50481 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lhx3P50481 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lhx3P50481 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lhx3P50481 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lhx3P50481 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lhx3P50481 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lhx3P50481 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lhx3P50481 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lhx3P50481 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lhx3P50481 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lhx3P50481 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lhx3P50481 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lhx3P50481 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lhx3P50481 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lhx3P50481 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lhx3P50481 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lhx3P50481 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lhx3P50481 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lhx3P50481 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lhx3P50481 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lhx3P50481 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms