Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cav1P49817 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cav1P49817 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cav1P49817 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cav1P49817 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cav1P49817 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cav1P49817 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cav1P49817 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cav1P49817 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cav1P49817 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cav1P49817 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cav1P49817 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cav1P49817 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cav1P49817 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cav1P49817 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cav1P49817 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cav1P49817 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cav1P49817 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cav1P49817 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cav1P49817 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cav1P49817 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cav1P49817 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cav1P49817 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cav1P49817 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cav1P49817 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cav1P49817 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cav1P49817 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cav1P49817 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cav1P49817 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cav1P49817 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cav1P49817 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cav1P49817 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cav1P49817 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cav1P49817 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cav1P49817 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cav1P49817 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cav1P49817 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cav1P49817 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cav1P49817 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cav1P49817 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cav1P49817 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cav1P49817 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cav1P49817 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cav1P49817 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cav1P49817 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cav1P49817 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cav1P49817 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cav1P49817 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cav1P49817 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cav1P49817 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cav1P49817 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cav1P49817 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cav1P49817 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cav1P49817 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cav1P49817 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cav1P49817 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cav1P49817 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cav1P49817 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cav1P49817 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cav1P49817 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cav1P49817 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cav1P49817 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms