Protein–RNA interactions for Protein: P49717

Mcm4, DNA replication licensing factor MCM4, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm4P49717 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mcm4P49717 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mcm4P49717 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mcm4P49717 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mcm4P49717 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mcm4P49717 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mcm4P49717 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mcm4P49717 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mcm4P49717 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mcm4P49717 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mcm4P49717 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mcm4P49717 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mcm4P49717 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mcm4P49717 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mcm4P49717 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mcm4P49717 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mcm4P49717 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mcm4P49717 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mcm4P49717 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mcm4P49717 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mcm4P49717 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mcm4P49717 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mcm4P49717 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mcm4P49717 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mcm4P49717 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mcm4P49717 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mcm4P49717 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mcm4P49717 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mcm4P49717 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Mcm4P49717 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Mcm4P49717 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mcm4P49717 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mcm4P49717 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mcm4P49717 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mcm4P49717 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mcm4P49717 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mcm4P49717 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mcm4P49717 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mcm4P49717 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Mcm4P49717 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mcm4P49717 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mcm4P49717 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Mcm4P49717 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mcm4P49717 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mcm4P49717 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mcm4P49717 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mcm4P49717 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mcm4P49717 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mcm4P49717 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Mcm4P49717 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mcm4P49717 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mcm4P49717 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Mcm4P49717 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Mcm4P49717 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Mcm4P49717 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mcm4P49717 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mcm4P49717 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Mcm4P49717 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mcm4P49717 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mcm4P49717 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Mcm4P49717 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Mcm4P49717 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mcm4P49717 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Mcm4P49717 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Mcm4P49717 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mcm4P49717 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mcm4P49717 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mcm4P49717 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mcm4P49717 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms