Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VdrP48281 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VdrP48281 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VdrP48281 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VdrP48281 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VdrP48281 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VdrP48281 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VdrP48281 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VdrP48281 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VdrP48281 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VdrP48281 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VdrP48281 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VdrP48281 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VdrP48281 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VdrP48281 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VdrP48281 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VdrP48281 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VdrP48281 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VdrP48281 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VdrP48281 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VdrP48281 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VdrP48281 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VdrP48281 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VdrP48281 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VdrP48281 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VdrP48281 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VdrP48281 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VdrP48281 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VdrP48281 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
VdrP48281 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VdrP48281 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VdrP48281 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VdrP48281 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VdrP48281 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VdrP48281 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VdrP48281 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VdrP48281 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VdrP48281 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VdrP48281 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VdrP48281 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VdrP48281 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VdrP48281 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VdrP48281 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VdrP48281 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VdrP48281 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VdrP48281 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VdrP48281 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VdrP48281 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VdrP48281 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VdrP48281 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VdrP48281 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VdrP48281 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VdrP48281 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VdrP48281 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VdrP48281 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VdrP48281 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VdrP48281 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VdrP48281 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VdrP48281 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VdrP48281 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VdrP48281 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VdrP48281 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VdrP48281 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VdrP48281 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VdrP48281 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VdrP48281 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VdrP48281 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VdrP48281 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VdrP48281 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VdrP48281 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VdrP48281 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VdrP48281 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VdrP48281 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VdrP48281 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VdrP48281 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VdrP48281 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VdrP48281 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VdrP48281 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VdrP48281 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VdrP48281 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VdrP48281 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VdrP48281 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VdrP48281 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VdrP48281 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VdrP48281 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VdrP48281 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VdrP48281 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VdrP48281 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VdrP48281 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VdrP48281 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VdrP48281 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VdrP48281 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VdrP48281 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VdrP48281 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VdrP48281 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VdrP48281 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VdrP48281 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VdrP48281 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VdrP48281 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VdrP48281 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms