Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NsfP46460 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NsfP46460 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NsfP46460 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NsfP46460 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NsfP46460 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NsfP46460 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NsfP46460 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NsfP46460 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NsfP46460 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NsfP46460 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NsfP46460 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NsfP46460 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NsfP46460 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NsfP46460 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NsfP46460 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NsfP46460 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NsfP46460 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NsfP46460 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NsfP46460 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NsfP46460 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NsfP46460 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NsfP46460 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NsfP46460 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NsfP46460 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NsfP46460 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NsfP46460 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NsfP46460 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NsfP46460 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NsfP46460 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NsfP46460 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NsfP46460 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NsfP46460 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NsfP46460 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NsfP46460 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NsfP46460 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NsfP46460 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NsfP46460 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NsfP46460 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NsfP46460 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NsfP46460 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NsfP46460 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NsfP46460 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NsfP46460 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NsfP46460 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NsfP46460 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NsfP46460 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NsfP46460 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NsfP46460 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NsfP46460 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NsfP46460 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NsfP46460 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NsfP46460 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NsfP46460 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NsfP46460 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NsfP46460 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NsfP46460 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NsfP46460 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NsfP46460 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NsfP46460 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NsfP46460 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NsfP46460 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NsfP46460 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NsfP46460 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NsfP46460 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NsfP46460 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NsfP46460 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NsfP46460 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NsfP46460 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NsfP46460 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NsfP46460 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NsfP46460 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NsfP46460 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NsfP46460 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NsfP46460 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NsfP46460 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NsfP46460 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NsfP46460 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NsfP46460 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NsfP46460 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NsfP46460 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NsfP46460 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NsfP46460 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NsfP46460 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NsfP46460 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NsfP46460 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NsfP46460 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NsfP46460 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NsfP46460 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsfP46460 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsfP46460 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsfP46460 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsfP46460 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsfP46460 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsfP46460 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NsfP46460 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NsfP46460 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NsfP46460 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NsfP46460 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NsfP46460 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms