Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbx1P41778 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pbx1P41778 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pbx1P41778 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pbx1P41778 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pbx1P41778 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pbx1P41778 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pbx1P41778 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pbx1P41778 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbx1P41778 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pbx1P41778 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pbx1P41778 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pbx1P41778 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pbx1P41778 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pbx1P41778 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pbx1P41778 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbx1P41778 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbx1P41778 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pbx1P41778 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pbx1P41778 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pbx1P41778 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pbx1P41778 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Pbx1P41778 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbx1P41778 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbx1P41778 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbx1P41778 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pbx1P41778 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbx1P41778 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbx1P41778 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pbx1P41778 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pbx1P41778 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pbx1P41778 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pbx1P41778 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pbx1P41778 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pbx1P41778 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pbx1P41778 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pbx1P41778 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pbx1P41778 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pbx1P41778 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pbx1P41778 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pbx1P41778 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pbx1P41778 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pbx1P41778 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pbx1P41778 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pbx1P41778 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pbx1P41778 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pbx1P41778 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pbx1P41778 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pbx1P41778 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Pbx1P41778 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pbx1P41778 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pbx1P41778 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms