Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl28P41105 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl28P41105 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl28P41105 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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