Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfc1P35601 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfc1P35601 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfc1P35601 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfc1P35601 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfc1P35601 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfc1P35601 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfc1P35601 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfc1P35601 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfc1P35601 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfc1P35601 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfc1P35601 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfc1P35601 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfc1P35601 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfc1P35601 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfc1P35601 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfc1P35601 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfc1P35601 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfc1P35601 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfc1P35601 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfc1P35601 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfc1P35601 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfc1P35601 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfc1P35601 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfc1P35601 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfc1P35601 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfc1P35601 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfc1P35601 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfc1P35601 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfc1P35601 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfc1P35601 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms