Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptk2P34152 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptk2P34152 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ptk2P34152 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptk2P34152 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptk2P34152 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptk2P34152 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptk2P34152 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptk2P34152 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptk2P34152 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptk2P34152 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptk2P34152 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptk2P34152 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptk2P34152 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptk2P34152 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptk2P34152 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptk2P34152 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptk2P34152 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptk2P34152 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptk2P34152 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptk2P34152 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptk2P34152 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptk2P34152 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptk2P34152 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptk2P34152 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptk2P34152 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptk2P34152 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptk2P34152 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptk2P34152 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptk2P34152 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptk2P34152 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptk2P34152 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Ptk2P34152 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptk2P34152 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms