Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ifnar1P33896 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ifnar1P33896 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ifnar1P33896 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ifnar1P33896 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ifnar1P33896 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ifnar1P33896 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ifnar1P33896 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ifnar1P33896 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ifnar1P33896 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ifnar1P33896 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ifnar1P33896 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ifnar1P33896 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ifnar1P33896 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ifnar1P33896 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ifnar1P33896 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ifnar1P33896 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ifnar1P33896 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ifnar1P33896 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ifnar1P33896 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ifnar1P33896 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ifnar1P33896 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ifnar1P33896 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ifnar1P33896 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ifnar1P33896 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ifnar1P33896 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ifnar1P33896 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ifnar1P33896 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ifnar1P33896 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ifnar1P33896 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ifnar1P33896 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ifnar1P33896 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ifnar1P33896 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ifnar1P33896 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ifnar1P33896 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ifnar1P33896 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ifnar1P33896 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ifnar1P33896 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms