Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd28P31041 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd28P31041 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd28P31041 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd28P31041 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd28P31041 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd28P31041 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd28P31041 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd28P31041 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd28P31041 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd28P31041 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd28P31041 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cd28P31041 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd28P31041 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd28P31041 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd28P31041 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd28P31041 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd28P31041 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd28P31041 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd28P31041 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd28P31041 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cd28P31041 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cd28P31041 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cd28P31041 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cd28P31041 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cd28P31041 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd28P31041 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd28P31041 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd28P31041 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd28P31041 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd28P31041 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd28P31041 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cd28P31041 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cd28P31041 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd28P31041 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd28P31041 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cd28P31041 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cd28P31041 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd28P31041 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd28P31041 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd28P31041 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd28P31041 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd28P31041 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd28P31041 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms