Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DesP31001 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DesP31001 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DesP31001 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DesP31001 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DesP31001 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DesP31001 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DesP31001 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DesP31001 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DesP31001 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DesP31001 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DesP31001 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DesP31001 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DesP31001 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DesP31001 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DesP31001 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DesP31001 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DesP31001 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DesP31001 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DesP31001 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DesP31001 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DesP31001 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DesP31001 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DesP31001 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DesP31001 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DesP31001 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DesP31001 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DesP31001 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DesP31001 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DesP31001 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DesP31001 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DesP31001 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DesP31001 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DesP31001 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DesP31001 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DesP31001 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DesP31001 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DesP31001 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DesP31001 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DesP31001 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DesP31001 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DesP31001 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DesP31001 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DesP31001 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DesP31001 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DesP31001 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DesP31001 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DesP31001 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DesP31001 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DesP31001 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DesP31001 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DesP31001 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DesP31001 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DesP31001 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DesP31001 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DesP31001 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DesP31001 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DesP31001 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DesP31001 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DesP31001 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DesP31001 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DesP31001 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DesP31001 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DesP31001 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DesP31001 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DesP31001 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DesP31001 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DesP31001 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DesP31001 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DesP31001 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DesP31001 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DesP31001 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DesP31001 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DesP31001 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DesP31001 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DesP31001 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DesP31001 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DesP31001 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DesP31001 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DesP31001 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DesP31001 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DesP31001 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DesP31001 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DesP31001 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DesP31001 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DesP31001 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DesP31001 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DesP31001 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DesP31001 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DesP31001 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DesP31001 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DesP31001 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DesP31001 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DesP31001 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DesP31001 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DesP31001 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DesP31001 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DesP31001 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DesP31001 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DesP31001 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms