Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pabpc1P29341 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc1P29341 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpc1P29341 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpc1P29341 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpc1P29341 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpc1P29341 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpc1P29341 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpc1P29341 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpc1P29341 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpc1P29341 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc1P29341 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc1P29341 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc1P29341 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc1P29341 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc1P29341 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc1P29341 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc1P29341 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc1P29341 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc1P29341 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc1P29341 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc1P29341 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc1P29341 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc1P29341 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc1P29341 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc1P29341 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc1P29341 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc1P29341 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc1P29341 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc1P29341 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc1P29341 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc1P29341 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc1P29341 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc1P29341 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc1P29341 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc1P29341 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc1P29341 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc1P29341 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc1P29341 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc1P29341 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc1P29341 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc1P29341 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc1P29341 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc1P29341 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc1P29341 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpc1P29341 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc1P29341 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpc1P29341 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpc1P29341 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpc1P29341 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc1P29341 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc1P29341 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc1P29341 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc1P29341 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc1P29341 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc1P29341 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc1P29341 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Pabpc1P29341 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pabpc1P29341 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pabpc1P29341 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc1P29341 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc1P29341 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc1P29341 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc1P29341 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc1P29341 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc1P29341 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc1P29341 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc1P29341 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpc1P29341 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpc1P29341 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpc1P29341 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpc1P29341 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpc1P29341 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc1P29341 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc1P29341 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc1P29341 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc1P29341 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc1P29341 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc1P29341 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc1P29341 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc1P29341 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc1P29341 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc1P29341 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms