Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd247P24161 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd247P24161 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd247P24161 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd247P24161 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd247P24161 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd247P24161 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd247P24161 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd247P24161 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd247P24161 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd247P24161 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd247P24161 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd247P24161 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd247P24161 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd247P24161 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd247P24161 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd247P24161 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd247P24161 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd247P24161 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd247P24161 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd247P24161 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd247P24161 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd247P24161 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd247P24161 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd247P24161 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd247P24161 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd247P24161 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd247P24161 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd247P24161 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd247P24161 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd247P24161 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd247P24161 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd247P24161 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd247P24161 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd247P24161 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd247P24161 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd247P24161 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd247P24161 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd247P24161 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd247P24161 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd247P24161 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd247P24161 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd247P24161 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cd247P24161 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd247P24161 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd247P24161 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd247P24161 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd247P24161 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd247P24161 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd247P24161 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd247P24161 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd247P24161 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd247P24161 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd247P24161 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd247P24161 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd247P24161 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd247P24161 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd247P24161 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd247P24161 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd247P24161 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd247P24161 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd247P24161 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd247P24161 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cd247P24161 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd247P24161 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd247P24161 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd247P24161 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd247P24161 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd247P24161 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd247P24161 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd247P24161 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd247P24161 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd247P24161 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd247P24161 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd247P24161 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd247P24161 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd247P24161 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd247P24161 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd247P24161 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd247P24161 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd247P24161 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd247P24161 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd247P24161 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd247P24161 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd247P24161 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd247P24161 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd247P24161 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd247P24161 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd247P24161 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd247P24161 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd247P24161 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd247P24161 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd247P24161 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd247P24161 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd247P24161 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd247P24161 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd247P24161 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd247P24161 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd247P24161 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd247P24161 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms