Protein–RNA interactions for Protein: P19788

Mgp, Matrix Gla protein, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MgpP19788 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MgpP19788 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MgpP19788 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MgpP19788 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MgpP19788 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MgpP19788 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MgpP19788 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MgpP19788 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MgpP19788 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MgpP19788 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MgpP19788 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MgpP19788 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MgpP19788 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MgpP19788 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MgpP19788 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MgpP19788 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MgpP19788 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MgpP19788 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MgpP19788 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MgpP19788 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MgpP19788 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MgpP19788 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MgpP19788 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MgpP19788 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MgpP19788 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MgpP19788 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MgpP19788 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MgpP19788 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MgpP19788 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MgpP19788 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MgpP19788 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MgpP19788 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MgpP19788 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MgpP19788 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MgpP19788 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MgpP19788 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MgpP19788 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MgpP19788 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MgpP19788 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MgpP19788 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MgpP19788 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MgpP19788 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MgpP19788 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MgpP19788 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MgpP19788 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MgpP19788 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MgpP19788 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MgpP19788 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MgpP19788 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MgpP19788 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MgpP19788 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MgpP19788 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MgpP19788 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MgpP19788 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MgpP19788 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MgpP19788 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MgpP19788 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MgpP19788 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MgpP19788 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MgpP19788 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MgpP19788 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MgpP19788 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MgpP19788 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MgpP19788 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MgpP19788 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MgpP19788 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MgpP19788 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MgpP19788 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MgpP19788 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MgpP19788 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MgpP19788 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MgpP19788 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MgpP19788 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MgpP19788 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MgpP19788 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MgpP19788 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MgpP19788 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MgpP19788 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MgpP19788 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MgpP19788 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MgpP19788 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MgpP19788 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MgpP19788 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MgpP19788 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MgpP19788 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MgpP19788 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MgpP19788 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MgpP19788 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MgpP19788 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MgpP19788 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MgpP19788 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MgpP19788 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MgpP19788 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MgpP19788 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MgpP19788 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MgpP19788 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MgpP19788 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MgpP19788 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MgpP19788 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MgpP19788 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms