Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
PrphP15331 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
PrphP15331 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
PrphP15331 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
PrphP15331 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
PrphP15331 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
PrphP15331 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
PrphP15331 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
PrphP15331 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
PrphP15331 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
PrphP15331 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
PrphP15331 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
PrphP15331 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,56■■□□□ 1,68
PrphP15331 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
PrphP15331 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
PrphP15331 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
PrphP15331 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
PrphP15331 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,51■■□□□ 1,67
PrphP15331 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
PrphP15331 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
PrphP15331 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
PrphP15331 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
PrphP15331 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
PrphP15331 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
PrphP15331 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
PrphP15331 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
PrphP15331 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
PrphP15331 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
PrphP15331 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
PrphP15331 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
PrphP15331 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
PrphP15331 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
PrphP15331 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
PrphP15331 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
PrphP15331 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
PrphP15331 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,45■■□□□ 1,66
PrphP15331 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
PrphP15331 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
PrphP15331 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
PrphP15331 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
PrphP15331 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
PrphP15331 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
PrphP15331 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
PrphP15331 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
PrphP15331 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
PrphP15331 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
PrphP15331 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
PrphP15331 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
PrphP15331 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
PrphP15331 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
PrphP15331 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
PrphP15331 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25,4■■□□□ 1,66
PrphP15331 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
PrphP15331 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25,39■■□□□ 1,66
PrphP15331 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
PrphP15331 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
PrphP15331 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25,38■■□□□ 1,65
PrphP15331 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
PrphP15331 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
PrphP15331 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
PrphP15331 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
PrphP15331 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
PrphP15331 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
PrphP15331 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
PrphP15331 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
PrphP15331 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
PrphP15331 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
PrphP15331 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
PrphP15331 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
PrphP15331 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25,32■■□□□ 1,64
PrphP15331 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,31■■□□□ 1,64
PrphP15331 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25,3■■□□□ 1,64
PrphP15331 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
PrphP15331 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
PrphP15331 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
PrphP15331 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
PrphP15331 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
PrphP15331 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
PrphP15331 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
PrphP15331 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
PrphP15331 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25,29■■□□□ 1,64
PrphP15331 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
PrphP15331 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
PrphP15331 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
PrphP15331 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,28■■□□□ 1,64
PrphP15331 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
PrphP15331 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
PrphP15331 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
PrphP15331 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
PrphP15331 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
PrphP15331 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
PrphP15331 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
PrphP15331 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
PrphP15331 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
PrphP15331 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
PrphP15331 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
PrphP15331 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
PrphP15331 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
PrphP15331 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,23■■□□□ 1,63
PrphP15331 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42,7 ms