Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntn1P12960 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cntn1P12960 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cntn1P12960 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntn1P12960 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntn1P12960 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntn1P12960 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntn1P12960 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntn1P12960 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntn1P12960 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntn1P12960 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntn1P12960 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntn1P12960 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntn1P12960 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntn1P12960 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntn1P12960 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntn1P12960 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntn1P12960 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntn1P12960 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntn1P12960 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntn1P12960 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cntn1P12960 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cntn1P12960 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cntn1P12960 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntn1P12960 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntn1P12960 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntn1P12960 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntn1P12960 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntn1P12960 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntn1P12960 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn1P12960 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn1P12960 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn1P12960 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn1P12960 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn1P12960 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntn1P12960 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntn1P12960 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntn1P12960 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn1P12960 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn1P12960 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn1P12960 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntn1P12960 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn1P12960 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn1P12960 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn1P12960 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn1P12960 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn1P12960 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn1P12960 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntn1P12960 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn1P12960 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn1P12960 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn1P12960 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn1P12960 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn1P12960 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn1P12960 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn1P12960 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn1P12960 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn1P12960 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn1P12960 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn1P12960 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn1P12960 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn1P12960 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn1P12960 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn1P12960 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn1P12960 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn1P12960 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn1P12960 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn1P12960 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn1P12960 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn1P12960 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn1P12960 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn1P12960 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn1P12960 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn1P12960 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn1P12960 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn1P12960 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn1P12960 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn1P12960 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn1P12960 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms