Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PolP11369 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PolP11369 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PolP11369 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PolP11369 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PolP11369 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PolP11369 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PolP11369 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PolP11369 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PolP11369 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PolP11369 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PolP11369 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PolP11369 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PolP11369 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PolP11369 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PolP11369 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PolP11369 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PolP11369 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PolP11369 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PolP11369 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PolP11369 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PolP11369 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PolP11369 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PolP11369 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PolP11369 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PolP11369 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PolP11369 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PolP11369 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PolP11369 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PolP11369 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PolP11369 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PolP11369 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PolP11369 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PolP11369 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PolP11369 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PolP11369 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PolP11369 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PolP11369 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PolP11369 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PolP11369 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PolP11369 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PolP11369 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PolP11369 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PolP11369 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PolP11369 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PolP11369 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PolP11369 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PolP11369 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PolP11369 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PolP11369 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PolP11369 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PolP11369 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PolP11369 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PolP11369 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PolP11369 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PolP11369 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PolP11369 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PolP11369 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PolP11369 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PolP11369 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PolP11369 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PolP11369 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PolP11369 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolP11369 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PolP11369 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PolP11369 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PolP11369 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PolP11369 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PolP11369 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PolP11369 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PolP11369 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PolP11369 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PolP11369 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PolP11369 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PolP11369 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PolP11369 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PolP11369 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PolP11369 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PolP11369 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PolP11369 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PolP11369 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PolP11369 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PolP11369 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PolP11369 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PolP11369 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PolP11369 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PolP11369 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PolP11369 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PolP11369 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PolP11369 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PolP11369 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PolP11369 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PolP11369 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PolP11369 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PolP11369 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PolP11369 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PolP11369 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PolP11369 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PolP11369 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PolP11369 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.4 ms