Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cxcl2P10889 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cxcl2P10889 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcl2P10889 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cxcl2P10889 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcl2P10889 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms