Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl1P10146 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl1P10146 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl1P10146 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccl1P10146 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl1P10146 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl1P10146 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccl1P10146 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl1P10146 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl1P10146 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl1P10146 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccl1P10146 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccl1P10146 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccl1P10146 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl1P10146 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl1P10146 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms