Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifna9P09235 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifna9P09235 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifna9P09235 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifna9P09235 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifna9P09235 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifna9P09235 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifna9P09235 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifna9P09235 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifna9P09235 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifna9P09235 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifna9P09235 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifna9P09235 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifna9P09235 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifna9P09235 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifna9P09235 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifna9P09235 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms