Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cd3dP04235 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cd3dP04235 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cd3dP04235 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cd3dP04235 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cd3dP04235 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cd3dP04235 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cd3dP04235 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cd3dP04235 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cd3dP04235 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cd3dP04235 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cd3dP04235 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cd3dP04235 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cd3dP04235 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cd3dP04235 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cd3dP04235 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cd3dP04235 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cd3dP04235 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cd3dP04235 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cd3dP04235 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cd3dP04235 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cd3dP04235 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cd3dP04235 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cd3dP04235 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cd3dP04235 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cd3dP04235 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cd3dP04235 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cd3dP04235 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cd3dP04235 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cd3dP04235 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cd3dP04235 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cd3dP04235 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cd3dP04235 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cd3dP04235 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cd3dP04235 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cd3dP04235 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cd3dP04235 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cd3dP04235 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cd3dP04235 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cd3dP04235 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cd3dP04235 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cd3dP04235 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cd3dP04235 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cd3dP04235 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cd3dP04235 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cd3dP04235 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cd3dP04235 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cd3dP04235 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cd3dP04235 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cd3dP04235 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cd3dP04235 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cd3dP04235 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cd3dP04235 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cd3dP04235 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cd3dP04235 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cd3dP04235 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cd3dP04235 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cd3dP04235 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cd3dP04235 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cd3dP04235 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cd3dP04235 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cd3dP04235 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cd3dP04235 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cd3dP04235 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cd3dP04235 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cd3dP04235 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cd3dP04235 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cd3dP04235 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cd3dP04235 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cd3dP04235 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cd3dP04235 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cd3dP04235 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cd3dP04235 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cd3dP04235 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cd3dP04235 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cd3dP04235 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cd3dP04235 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cd3dP04235 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cd3dP04235 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cd3dP04235 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cd3dP04235 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cd3dP04235 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cd3dP04235 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms