Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P04213 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P04213 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P04213 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P04213 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
P04213 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
P04213 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04213 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04213 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04213 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04213 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04213 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04213 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
P04213 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04213 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P04213 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P04213 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
P04213 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04213 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04213 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04213 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04213 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P04213 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P04213 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P04213 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P04213 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P04213 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
P04213 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P04213 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P04213 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P04213 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P04213 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P04213 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P04213 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P04213 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P04213 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P04213 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P04213 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P04213 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P04213 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P04213 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P04213 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P04213 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P04213 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P04213 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P04213 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P04213 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P04213 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P04213 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P04213 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P04213 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P04213 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P04213 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P04213 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P04213 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P04213 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P04213 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P04213 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P04213 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P04213 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P04213 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P04213 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P04213 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P04213 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P04213 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P04213 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P04213 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P04213 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P04213 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P04213 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P04213 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
P04213 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P04213 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P04213 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
P04213 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P04213 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P04213 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P04213 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P04213 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P04213 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P04213 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P04213 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P04213 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P04213 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P04213 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P04213 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P04213 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P04213 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04213 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04213 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04213 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P04213 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P04213 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P04213 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P04213 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P04213 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P04213 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P04213 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P04213 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P04213 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms