Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GzmbP04187 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GzmbP04187 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GzmbP04187 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GzmbP04187 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GzmbP04187 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GzmbP04187 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GzmbP04187 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GzmbP04187 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GzmbP04187 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GzmbP04187 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GzmbP04187 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GzmbP04187 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GzmbP04187 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GzmbP04187 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GzmbP04187 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GzmbP04187 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GzmbP04187 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GzmbP04187 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GzmbP04187 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GzmbP04187 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GzmbP04187 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GzmbP04187 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GzmbP04187 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GzmbP04187 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GzmbP04187 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GzmbP04187 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GzmbP04187 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GzmbP04187 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GzmbP04187 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GzmbP04187 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GzmbP04187 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GzmbP04187 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GzmbP04187 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GzmbP04187 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GzmbP04187 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GzmbP04187 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GzmbP04187 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GzmbP04187 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GzmbP04187 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GzmbP04187 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GzmbP04187 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GzmbP04187 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GzmbP04187 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GzmbP04187 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GzmbP04187 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GzmbP04187 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GzmbP04187 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GzmbP04187 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GzmbP04187 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GzmbP04187 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GzmbP04187 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GzmbP04187 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GzmbP04187 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GzmbP04187 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms