Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt10P02535 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt10P02535 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt10P02535 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt10P02535 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt10P02535 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt10P02535 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt10P02535 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt10P02535 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt10P02535 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt10P02535 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt10P02535 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt10P02535 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt10P02535 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt10P02535 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt10P02535 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt10P02535 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt10P02535 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt10P02535 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt10P02535 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt10P02535 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt10P02535 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt10P02535 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt10P02535 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt10P02535 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt10P02535 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt10P02535 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt10P02535 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt10P02535 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt10P02535 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt10P02535 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt10P02535 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt10P02535 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt10P02535 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt10P02535 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt10P02535 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt10P02535 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt10P02535 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt10P02535 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt10P02535 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Krt10P02535 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt10P02535 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt10P02535 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt10P02535 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt10P02535 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt10P02535 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt10P02535 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt10P02535 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt10P02535 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt10P02535 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt10P02535 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt10P02535 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt10P02535 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt10P02535 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt10P02535 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt10P02535 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt10P02535 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt10P02535 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt10P02535 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt10P02535 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt10P02535 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt10P02535 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt10P02535 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt10P02535 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt10P02535 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt10P02535 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt10P02535 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt10P02535 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt10P02535 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt10P02535 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt10P02535 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt10P02535 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt10P02535 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt10P02535 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt10P02535 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt10P02535 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt10P02535 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt10P02535 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt10P02535 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt10P02535 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt10P02535 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms