Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
P01729 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16,99■□□□□ 0,31
P01729 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
P01729 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
P01729 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
P01729 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
P01729 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
P01729 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
P01729 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,97■□□□□ 0,31
P01729 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
P01729 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
P01729 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,96■□□□□ 0,31
P01729 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16,96■□□□□ 0,31
P01729 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
P01729 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
P01729 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
P01729 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16,95■□□□□ 0,3
P01729 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
P01729 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
P01729 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
P01729 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
P01729 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
P01729 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
P01729 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
P01729 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
P01729 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16,93■□□□□ 0,3
P01729 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,92■□□□□ 0,3
P01729 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16,92■□□□□ 0,3
P01729 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16,92■□□□□ 0,3
P01729 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16,92■□□□□ 0,3
P01729 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,92■□□□□ 0,3
P01729 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
P01729 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16,91■□□□□ 0,3
P01729 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
P01729 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
P01729 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
P01729 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
P01729 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
P01729 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,3
P01729 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
P01729 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
P01729 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
P01729 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16,89■□□□□ 0,29
P01729 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
P01729 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
P01729 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16,88■□□□□ 0,29
P01729 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
P01729 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
P01729 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
P01729 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
P01729 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
P01729 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
P01729 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
P01729 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
P01729 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
P01729 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
P01729 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
P01729 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,86■□□□□ 0,29
P01729 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
P01729 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16,86■□□□□ 0,29
P01729 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16,86■□□□□ 0,29
P01729 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
P01729 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
P01729 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,86■□□□□ 0,29
P01729 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
P01729 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
P01729 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16,85■□□□□ 0,29
P01729 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16,85■□□□□ 0,29
P01729 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
P01729 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
P01729 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,84■□□□□ 0,29
P01729 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16,84■□□□□ 0,29
P01729 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16,83■□□□□ 0,28
P01729 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
P01729 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
P01729 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
P01729 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
P01729 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,82■□□□□ 0,28
P01729 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16,81■□□□□ 0,28
P01729 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,81■□□□□ 0,28
P01729 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16,81■□□□□ 0,28
P01729 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,81■□□□□ 0,28
P01729 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
P01729 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16,8■□□□□ 0,28
P01729 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16,8■□□□□ 0,28
P01729 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
P01729 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
P01729 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
P01729 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16,79■□□□□ 0,28
P01729 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
P01729 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16,79■□□□□ 0,28
P01729 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
P01729 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,78■□□□□ 0,28
P01729 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
P01729 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16,77■□□□□ 0,28
P01729 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,27
P01729 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16,77■□□□□ 0,27
P01729 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,27
P01729 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,76■□□□□ 0,27
P01729 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16,76■□□□□ 0,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms