Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01664 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01664 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
P01664 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01664 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01664 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01664 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01664 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01664 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01664 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01664 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
P01664 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01664 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01664 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01664 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01664 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01664 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01664 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01664 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
P01664 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01664 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01664 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01664 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01664 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01664 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01664 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01664 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01664 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
P01664 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01664 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01664 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01664 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01664 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01664 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01664 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01664 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
P01664 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01664 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01664 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01664 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
P01664 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01664 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01664 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01664 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01664 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
P01664 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01664 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
P01664 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01664 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01664 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
P01664 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01664 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01664 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
P01664 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01664 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01664 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01664 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01664 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01664 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01664 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01664 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01664 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01664 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01664 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01664 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01664 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01664 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01664 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
P01664 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01664 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01664 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01664 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01664 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01664 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01664 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01664 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01664 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01664 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01664 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01664 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01664 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01664 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01664 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01664 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01664 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P01664 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P01664 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01664 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01664 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01664 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
P01664 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01664 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01664 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01664 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
P01664 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01664 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01664 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01664 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01664 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01664 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms