Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ifnb1P01575 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ifnb1P01575 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ifnb1P01575 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ifnb1P01575 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ifnb1P01575 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ifnb1P01575 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ifnb1P01575 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ifnb1P01575 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ifnb1P01575 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ifnb1P01575 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ifnb1P01575 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ifnb1P01575 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ifnb1P01575 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ifnb1P01575 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ifnb1P01575 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ifnb1P01575 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ifnb1P01575 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ifnb1P01575 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ifnb1P01575 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ifnb1P01575 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ifnb1P01575 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ifnb1P01575 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ifnb1P01575 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ifnb1P01575 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ifnb1P01575 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ifnb1P01575 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ifnb1P01575 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ifnb1P01575 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ifnb1P01575 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ifnb1P01575 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ifnb1P01575 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ifnb1P01575 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ifnb1P01575 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ifnb1P01575 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ifnb1P01575 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ifnb1P01575 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ifnb1P01575 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ifnb1P01575 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ifnb1P01575 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ifnb1P01575 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ifnb1P01575 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ifnb1P01575 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ifnb1P01575 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ifnb1P01575 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ifnb1P01575 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ifnb1P01575 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ifnb1P01575 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ifnb1P01575 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ifnb1P01575 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ifnb1P01575 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ifnb1P01575 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ifnb1P01575 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ifnb1P01575 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms