Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mtatp6P00848 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mtatp6P00848 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mtatp6P00848 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mtatp6P00848 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mtatp6P00848 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mtatp6P00848 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mtatp6P00848 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mtatp6P00848 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mtatp6P00848 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Mtatp6P00848 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mtatp6P00848 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mtatp6P00848 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mtatp6P00848 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mtatp6P00848 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mtatp6P00848 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mtatp6P00848 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mtatp6P00848 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mtatp6P00848 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms